Sistem pengudaraan rumah hijau memainkan peranan penting dalam kesihatan tumbuhan dan pengeluaran tanaman.Ramai ahli hortikultur pemula tidak mengaitkan pertumbuhan yang perlahan, hasil yang lemah, atau masalah dengan patogen kepada sistem pengudaraan rumah hijau yang tidak mencukupi.Kebanyakan tukang kebun memahami kepentingan sistem pengudaraan untuk kawalan suhu tetapi faedah yang diperoleh daripada sistem pengudaraan adalah pelbagai rupa.Sistem pengudaraan bukan sahaja penting untuk mengekalkan keadaan persekitaran tetapi ia juga mempengaruhi secara langsung keupayaan tumbuhan untuk melakukan fotosintesis, penyerapan unsur penting dan kitaran pembiakan lengkap (pendebungaan).Sistem pengudaraan rumah hijau melaksanakan empat fungsi penting: kawalan suhu, kawalan kelembapan, penggantian CO2/oksigen dan peredaran udara.